En 1999, la Municipalidad Metropolitana de Miraflores otorgó una medalla al CEPRECYT, en la persona de su director, por su labor de investigación y difusión de la ciencia. El Dr. Francisco Miroquesada Cantuarias y el Prof. León Trahtemberg fueron también galardonados.

     En 1993, el diario "La República" premió al CEPRECYT por considerarlo una valiosa contribución para el desarrollo del país.

     En 1997, la Universidad Ricardo Palma le otorgó una medalla por su labor de difusión de la ciencia y la tecnología.

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